Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms