Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms