Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfi1Q3UZY0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfi1Q3UZY0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms