Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga4Q3UW12 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnga4Q3UW12 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms