Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV70

Pdp1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp1Q3UV70 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdp1Q3UV70 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdp1Q3UV70 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms