Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms