Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Eb2Q3UUV9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Eb2Q3UUV9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms