Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trat1Q3UU67 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms