Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms