Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms