Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtl4Q3URY0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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