Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc190Q3URK1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms