Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbm20Q3UQS8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbm20Q3UQS8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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