Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms