Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mier3Q3UHF3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms