Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms