Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms