Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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Rnf180Q3U827 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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Rnf180Q3U827 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Rnf180Q3U827 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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Rnf180Q3U827 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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Rnf180Q3U827 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Rnf180Q3U827 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Rnf180Q3U827 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Rnf180Q3U827 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Rnf180Q3U827 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Rnf180Q3U827 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Rnf180Q3U827 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf180Q3U827 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Rnf180Q3U827 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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