Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl21Q3U410 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl21Q3U410 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms