Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms