Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc136Q3TVA9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms