Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh5Q3TSG4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh5Q3TSG4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms