Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp39Q3TIX9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp39Q3TIX9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp39Q3TIX9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp39Q3TIX9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp39Q3TIX9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp39Q3TIX9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms