Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd2bQ3T9M1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms