Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms