Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nlrp1aQ2LKU9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms