Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ptchd1Q14B62 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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