Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rpusd3Q14AI6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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