Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3ip1Q149C2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3ip1Q149C2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms