Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spatc1Q148B6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spatc1Q148B6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spatc1Q148B6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spatc1Q148B6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spatc1Q148B6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spatc1Q148B6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Spatc1Q148B6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Spatc1Q148B6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Spatc1Q148B6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Spatc1Q148B6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Spatc1Q148B6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spatc1Q148B6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms