Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkpd1Q0VF94 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms