Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmntd2Q0VET5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmntd2Q0VET5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms