Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cnnm1Q0GA42 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm1Q0GA42 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms