Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms