Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms