Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb2Q08331 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb2Q08331 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb2Q08331 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb2Q08331 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Calb2Q08331 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms