Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms