Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfiaQ02780 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms