Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb5Q02739 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms