Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnnb1Q02248 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnb1Q02248 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms