Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms