Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms