Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nbr1P97432 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms