Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx1P82976 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms