Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms