Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErfP70459 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ErfP70459 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ErfP70459 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ErfP70459 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ErfP70459 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ErfP70459 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ErfP70459 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ErfP70459 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ErfP70459 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ErfP70459 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ErfP70459 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ErfP70459 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ErfP70459 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ErfP70459 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ErfP70459 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms