Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad50P70388 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad50P70388 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad50P70388 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad50P70388 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad50P70388 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad50P70388 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms