Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms