Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra8P70278 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra8P70278 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra8P70278 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms