Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta1P68134 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta1P68134 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms